Google的大数据基因组学梦

来源: 生物360
2014/3/26 13:47:20
人类基因组测序能够揭示致命的突变,帮助科学家发现可拯救生命的药物,但个体基因组数据不是一个小数目,一个人的基因组数据加起来约有100GB,研究人员必须进行严格的分析才能在巨大的数据库中窥探到自己所需要的信息。

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本文关键字: 基因组 大数据 数据库

2012 年,亚马逊(Amazon)的云服务接管国际千人基因组计划数据存储,这是世界上最大的人类遗传学数据库。虽然数据是公开和免费的,但是研究人员使用亚马逊高性能的计算资源来运行数据计算是收费的。

广阔的发展空间

Ingenuity 系统公司的联合创始人Ramon Felciano 表示:“云空间目前仍处于起步阶段,还有很大的发展空间,特别是将一些企业特殊的云技术应用到新领域。”Ingenuity主要研发生物数据分析软件,最近被 Qiagen 收购。

Google 的 DNA Nexus提供基因数据的云存储。 Google 首席云计算总监(Chief Cloud Officer) Omar Serang表示, Google加入全球基因组学和健康联盟,是因为在目前的基因组数据处理领域没有一个通用的标准或格式,科学家和企业不能进行深入研究。

Felciano 认为:“信息是非常孤立的。”由于病人的隐私问题,基因数据的敏感性也通常会阻止非常简单的协作。

电子前沿基金会的资深专职律师李田(Lee Tien)认为:“基因研究的整个领域,特别是基于大数据和测序数据的基因研究,充满了隐私和伦理问题。”

隐私标准

虽然医院和学术机构必须遵守保护病人隐私的规则,但私人公司并不一定遵循这些标准,李田说。

全球基因组学与健康联盟成员正着手制定监管伦理、数据存储和安全的公共策略。就其本身而言, Google 表示,存储在其云端的基因组数据是安全的。该公司在其网站上表示:“私人数据依然保密,公共数据开放给任何人。”.

李田对此依然保持谨慎态度。“也许一切会很顺利。”他说,“但是其他情况下可能会有意想不到的事情--对于遗传数据,我们可都不希望出现意料外的事情。”

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责编:王雅京
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